Cartographie épidémiologique

En France, parmi les réalisations en cartographie épidémiologique, celles de l'INSERM sont parmi les plus riches et les plus fines en terme de fréquence de mise à jour des données. Les maladies concernées sont des maladies infectieuses, en particulier celles dont la propagation peut être très rapide à l'échelle d'un pays.
Citons en particulier le réseau Sentiweb, réseau de médecins et d'épidémiologistes qui tracent semaine après semaine les épidémies en France et dans les DOM-TOM.
Sur le site de Sentiweb, on trouvera en particulier des pages consacrées à des outils de cartographie interactive. D'autres outils ont été développés pour les épidémiologistes, en particulier sous la responsabilité de Laurent Toubiana, chercheur à l'INSERM (Equipe Systèmes Complexes et Epidémiologie, UPRES EA 222, Laboratoire de Biostatistique et d'Informatique Médicale). Mais tous ne sont pas en accès libre. Dommage...
A l'étranger, on peut citer le CDC américain (Center for Disease Control)(http://www.cdc.gov/flu/weekly/index.htm#whomap).
En France, l'INVS (Institut National de Veille Sanitaire) est chargé de mettre en oeuvre des programmes et des outils qui aident les épidémiologistes dans le suivi de certaines épidémies.
Le plus connu de ces outils est le programme Epi Info, développé depuis 1985 et constitué d'un éditeur de texte, d'une base de données, d'un logiciel d'analyses statistiques. Il est gratuit et peut-être téléchargé ici.
EpiMap est le logiciel cartographique qui permet de représenter spatialement les données d'Epi Info sous forme de cartes.
Ces outils sont développés par les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) et l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS).
Signalons que l'OMS a son propre programme de cartographie de la santé publique et SIG. On peut lire dans ce document que "le lancement par l’OMS du programme novateur de cartographie de la santé publique et SIG est en train de transformer la façon dont les informations géographiques sont utilisées pour contrôler les maladies, améliorer les soins médicaux et sauver des vies". Un SIG peut sauver des vies... me voila rassuré sur l'utilité des SIG et de la cartographie numérique.
Parmi les réalisations de l'OMS en matière de SIG, signalons en particulier l'application “HealthMapper” qui se veut "un système d’information et de cartographie interactif conçu pour les gestionnaires et décideurs de santé publique ayant besoin d’un accès simple à des bases de données, rapports, graphes, cartes et tableaux. Il a été créé pour rendre l’utilisation des SIG et la cartographie de la santé publique plus accessibles ainsi que pour faciliter la collecte, le stockage, l’accès, la gestion et l’analyse des données de santé publique, aux niveaux national et mondial.". Un travail de vulgarisation et de diffusion des technologies de cartographie numérique qui est suffisamment rare pour mériter d'être souligné, mais... l'application nécessite d'abord d'être téléchargée (51Mo!) sur son poste et installée.
Le site HealthMap (Digital Disease Detection) a été développé depuis deux ans par des informaticiens et des chercheurs en médecine de la Harvard Medical School. Vous pouvez en découvrir une présentation ici. Il s'agit d'un mashup, c'est-à-dire un site composite utilisant des fonds et l'API GoogleMaps et des données thématiques provenant de sources diverses disponibles sur Internet. Il en existe une version en français.
Signalons également (mais la liste n'est pas exhaustive), le programme ProMED-Mail de l'International Society for Infectious Diseases, qui propose aussi une cartographie interactive, qui est reprise dans l'application HealthMap.
En France, à titre exploratoire, l'université de Pau a développé un site qui permet de suivre pour l'année 2003 la cartographie de l'évolution de l'épidémie du SRAS sous la forme d'une cartographie animée et d'une cartographie interactive.
Enfin, à noter que récemment Google, en partenariat avec le CDC américain, a ouvert un site qui permet de suivre les épidémies de grippe aux Etats-Unis, état par état.